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當(dāng)前位置:首頁(yè) > 產(chǎn)品中心 > 實(shí)驗(yàn)試劑 > 酶類 > M3009.0250Genaxxon:SNP Pol DNA Polymerase

Genaxxon:SNP Pol DNA Polymerase

簡(jiǎn)要描述:Genaxxon我們?yōu)榭蛻籼峁┏^(guò)18年的高質(zhì)量PCR和qPCR產(chǎn)品的廣泛組合。 Genaxxon銷售 Genaxxon產(chǎn)品供應(yīng) Genaxxon:SNP Pol DNA Polymerase

  • 產(chǎn)品型號(hào):M3009.0250
  • 廠商性質(zhì):代理商
  • 更新時(shí)間:2025-05-08
  • 訪  問(wèn)  量:616

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品牌其他品牌貨號(hào)M3009.0250
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Genaxxon:SNP Pol DNA Polymerase

Genaxxon:SNP Pol DNA PolymeraseGenaxxon:SNP Pol DNA Polymerase

優(yōu)勢(shì)一覽

  • 出色的 SNP 檢測(cè),可可靠區(qū)分不同的等位基因

  • 性能優(yōu)異,特別適用于等位基因特異性 PCR (as-PCR),也是高選擇性 PCR 的選擇

  • 使用標(biāo)準(zhǔn)引物保證簡(jiǎn)單的引物設(shè)計(jì),您只需改變 3' 核苷酸

  • 保證高靈敏度:在 >10 000 個(gè)野生型拷貝中可檢測(cè)到少于 10 個(gè)突變拷貝

  • 由于基于適配體的熱啟動(dòng)功能,沒(méi)有假擴(kuò)增。



SNP - 等位基因特異性分配、基因分型和基因表達(dá)分析

為了成功區(qū)分等位基因特異性,需要對(duì) SNP 進(jìn)行基因分型和檢測(cè)點(diǎn)突變,例如在癌癥相關(guān)基因中。SNP Pol DNA 聚合酶是一種高選擇性的 DNA 聚合酶變體,專為需要等位基因特異性鑒別或高單核苷酸鑒別的所有方法而開發(fā)。例如,在等位基因特異性 PCR (ASA)、引物延伸或甲基化特異性 PCR (MSP) 中。

突變等位基因可以與野生型等位基因精確區(qū)分 - 無(wú)需測(cè)序,因?yàn)榫酆厦冈阱e(cuò)配的情況下不會(huì)擴(kuò)增!許多 DNA 聚合酶可耐受錯(cuò)配的引物-模板復(fù)合物,而 
SNP Pol DNA 聚合酶可有效區(qū)分這些復(fù)合物,并且僅在引物對(duì)匹配的情況下產(chǎn)生特異性擴(kuò)增子。這使得 SNP Pol DNA 聚合酶非常適合 SNP 檢測(cè)、HLA 基因分型或單個(gè) CpG 甲基化位點(diǎn)的分析!

SNP Pol DNA 聚合酶可有效區(qū)分 3' 端錯(cuò)配的引物。只有當(dāng)引物 100% 適合 3'-端時(shí),聚合酶才會(huì)擴(kuò)增。如果引物在 3' 端直接有一個(gè)堿基交換(點(diǎn)突變),則不會(huì)進(jìn)行擴(kuò)增。這種設(shè)計(jì)的聚合酶也可用作 SNP PolTaq 變體,其具有 5'-3'-核酸酶活性,因此可用作探針 qPCR 中的分子信標(biāo)或 TaqMan® 探針,用于基于水解探針的檢測(cè)。


產(chǎn)品信息 “SNP Pol DNA 聚合酶"

SNP Pol DNA 聚合酶用于簡(jiǎn)單、可靠和快速的等位基因特異性區(qū)分,例如。CRISPR / Cas9 點(diǎn)突變,用于檢測(cè)不正確的 CRISPR / Cas9 產(chǎn)物,或驗(yàn)證測(cè)序結(jié)果。SNP Pol DNA 聚合酶可區(qū)分高度特異性,無(wú)論是否存在引物-模板-復(fù)合物的不匹配。錯(cuò)配(點(diǎn)突變)必須在引物的 3 ' 端。因此,突變等位基因可以與野生型等位基因精確區(qū)分 - 無(wú)需測(cè)序,因?yàn)榫酆厦冈阱e(cuò)配的情況下根本不擴(kuò)增。

只需將引物放在假定的點(diǎn)突變上(重要提示:點(diǎn)突變必須在 3 '端),聚合酶就會(huì)以幾乎 100% 的準(zhǔn)確率檢測(cè)到該區(qū)域的錯(cuò)配:如果與引物的 3' 端互補(bǔ)的模板堿基顯示突變,而引物沒(méi)有,則不會(huì)發(fā)生擴(kuò)增 - 在短時(shí)間內(nèi) 100% 確定!
因此,SNP Pol DNA 聚合酶可以輕松、省時(shí)且經(jīng)濟(jì)高效地用于篩選點(diǎn)突變。

變體 SNP PolTaq DNA 聚合酶 > 具有 5'-3'核酸酶活性,因此可用于特異性水解探針,如 Taqman® 探針或分子信標(biāo)。


描述

SNP Pol DNA 聚合酶是一種高選擇性 DNA 聚合酶,用于檢測(cè) S單核苷酸 P卵形性。它是專門為等位基因特異性鑒別而開發(fā)的,其中需要非常高的鑒別率,例如,在等位基因特異性 PCR (ASA;AS-PCR)、等位基因特異性引物延伸 (AS-PEX)、SNP 分析、基因分型或甲基化特異性 PCR (MSP)。許多其他 DNA 聚合酶可耐受錯(cuò)配的引物-模板復(fù)合物,因此不適合。另一方面,SNP Pol DNA 聚合酶可以特異性地區(qū)分這些(高鑒別性),并且只提供具有匹配引物對(duì)的 PCR 產(chǎn)物!Genaxxon SNP Pol 和 SNP PolTaq DNA 聚合酶通過(guò)兩個(gè)等位基因之間的等位基因特異性 PCR 相差高達(dá) 100%,并且在簡(jiǎn)單的 qPCR 之后,給出了存在哪個(gè)等位基因的明確結(jié)果。因此,CRISPR/Cas9 技術(shù)的巨大潛力可用于人類醫(yī)學(xué)和植物生物技術(shù),尤其是與 SNP PolTaq 或 SNP Pol DNA 聚合酶一起使用。

等位基因特異性 PCR 可用于量化野生型序列池或背景中的突變率。NGS 確定的突變頻率的驗(yàn)證也可以通過(guò)等位基因特異性 PCR 和 SNP Pol DNA 聚合酶進(jìn)行驗(yàn)證。SNP PolTaq DNA 聚合酶非常適合液體活檢樣品的分析。使用 SNP PolTaq,可以很好地分析和量化癌癥突變的存在和頻率。

下圖:應(yīng)用資料 SNP Pol DNA 聚合酶

Genaxxon:SNP Pol DNA Polymerase

 

我們建議使用較短的擴(kuò)增子長(zhǎng)度(約 60-200 bp)以獲得最佳結(jié)果,但也建議使用較長(zhǎng)的擴(kuò)增子長(zhǎng)度。如果擴(kuò)增子較長(zhǎng) >500 bp),則可能需要添加額外的鎂 (+0.5 - 1.5 mM)。

故障排除:
PCR 30 個(gè)循環(huán)后沒(méi)有條帶!
缺失或弱條帶的優(yōu)化程序。

退火溫度過(guò)低!

注意力: SNP Pol 是一種適配體抑制的 DNA 聚合酶。使用的適配體寡核苷酸在 <55°C 的溫度下可逆地抑制聚合酶!因此,引物的理想退火溫度應(yīng)為 >57°C。

- real-time PCR 方法
- 檢查 dNTP 濃度。這應(yīng)該在 200 到 300 μM 之間(在 PCR 中)。
- 增加循環(huán)次數(shù)(至少 35 次,最好等于 40 次)

測(cè)試優(yōu)化 - 循環(huán)
次數(shù) 在終點(diǎn)檢測(cè)中,30 個(gè)循環(huán)計(jì)數(shù)并不總是足以生成清晰可見的波段。例如,以少于 200 個(gè) DNA 拷貝為起始值。因此,應(yīng)使用實(shí)時(shí) PCR 進(jìn)行檢測(cè),或者應(yīng)使用五個(gè)平行 PCR,其中一個(gè)在五個(gè)不同循環(huán)后從 PCR 設(shè)備中取出(示例如下)。

終點(diǎn)檢測(cè):
使用 SNP Pol DNA 聚合酶平行構(gòu)建 5 個(gè)相同的 PCR 反應(yīng)。 在 20、25、30、35 和 40 個(gè)循環(huán)中分別從循環(huán)儀中取出一個(gè) PCR 管,并在最后將所有五個(gè)反應(yīng)應(yīng)用于瓊脂糖凝膠。 這使得很容易識(shí)別 PCR 中給定應(yīng)用(起始材料、靶標(biāo)、引物)的最佳循環(huán)數(shù)。

含細(xì)胞裂解物
的 SNP Pol PCR 動(dòng)物細(xì)胞和大腸桿菌可直接用于 SNP Pol DNA 聚合酶的 PCR!無(wú)需單獨(dú)裂解或蛋白酶 K 消化。

PCR 程序:

1. 每個(gè) PCR 批次需要 50 - 500 個(gè)細(xì)胞!
2. 制備帶有引物和緩沖液的 PCR 混合物,并置于冰上!
3. 將挑選的菌落直接加入 10-20 μL 水中(無(wú)需單獨(dú)裂解,無(wú)需蛋白酶 K 消化), 短暫渦旋(5 秒),然后將該細(xì)胞懸液直接添加到 PCR 反應(yīng)混合物中,例如 10 μL 細(xì)胞懸液,用于 PCR 制備,總體積為 20 μL。2-3 分鐘的初始變性時(shí)間就足夠了 足夠,必要時(shí)可延長(zhǎng)至 5 分鐘。
每個(gè)反應(yīng)最多 100 個(gè)拷貝的基因組 DNA 相對(duì)較低,但應(yīng)該仍然有效。 該細(xì)胞懸液的其余部分也可以冷凍掉,以便進(jìn)行進(jìn)一步的測(cè)試。

可選:
4。如果可能:進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量 PCR!


SNP Pol DNA 聚合酶(M3009 > 或 M3061 >)可與非特異性熒光染料(例如 Genaxxon 的 Green DNA 染料 > 或 SybrGreen®)一起用于實(shí)時(shí) PCR。當(dāng)使用特異性 PCR 探針時(shí),只能使用 SNP PolTaq DNA 聚合酶,因?yàn)橹挥羞@些探針具有 5'-3'核酸外切酶活性。

使用我們的高質(zhì)量 dNTP(> Set (M3015.4100) 或混合 (M3016.1010) > 或我們的 DNALadders > 和我們有利的標(biāo)準(zhǔn)瓊脂糖 (M3044) >我們可以為您的 PCR 提供額外的產(chǎn)品。

SNP Pol DNA 和 SNP Pol DNA 聚合酶
的應(yīng)用領(lǐng)域 - 點(diǎn)突變的監(jiān)測(cè)、驗(yàn)證和檢測(cè)
- 鑒定正確或錯(cuò)誤的 CRISPR/Cas9 產(chǎn)品
- 測(cè)序結(jié)果
的驗(yàn)證/確認(rèn) - 突變的定量(例如 NGS 結(jié)果)
- 通過(guò)等位基因特異性擴(kuò)增 (ASA) / 等位基因特異性 PCR
進(jìn)行 SNP 檢測(cè)- 亞硫酸氫鹽處理 DNA 后的甲基化特異性 PCR (MSP)(CpG 甲基化側(cè))
- HLA 基因分型
- 微測(cè)序
- 使用水解探針進(jìn)行實(shí)時(shí) PCR
- 實(shí)時(shí)多重 PCR

- DamID-seq data in C. elegans.

As an alternative to ChIP, DNA adenine methyltransferase identification by sequencing (DamID-seq) was recently shown to be able to characterize binding sites in single mammalian cells. Additionally, DamID can be achieved for cell-type specific analysis by expressing Dam fusion proteins under tissue specific promoters in a controlled manner. In this report, we present a user-friendly pipeline to analyse DamID-seq data in C. elegans.

Sharma R, Ritler D, Meister P.
Tools for DNA adenine methyltransferase identification analysis of nuclear organization during C. elegans development. Genesis. 2016 Feb 4. doi: 10.1002/dvg.22925.

- Minisequencing SNP genotyping with SNPase DNA Polymerase can be carried out by the procedure described in:

Lovmar L, Fredriksson M, Liljedahl U, Sigurdsson S, Syv?nen AC. 
Quantitative evaluation by minisequencing and microarrays reveals accurate multiplexed SNP genotyping of whole genome amplified DNA. Nucleic Acids Res. 2003;31:e129.

- Allel specific mismatch selectivity by the HiDi DNA polymerase

Drum M, Kranaster R, Ewald C, Blasczyk R, Marx A (2014) Variants of a Thermus aquaticus DNA Polymerase with Increased Selectivity for Applications in Allele- and Methylation-Specific Amplification. PLoS ONE 9(5): e96640. doi:10.1371/journal.pone.0096640


應(yīng)用/應(yīng)用:

- 監(jiān)測(cè)、驗(yàn)證和檢測(cè)點(diǎn)突變 - 識(shí)別正確或錯(cuò)誤的 CRISPR/Cas9 產(chǎn)品 - 測(cè)序結(jié)果的驗(yàn)證/確認(rèn) - 突變定量(例如 NGS 結(jié)果) - 通過(guò)等位基因特異性擴(kuò)增 (ASA) / 等位基因特異性 PCR 進(jìn)行 SNP 檢測(cè) - 亞硫酸氫鹽處理 DNA 后的甲基化特異性 PCR (MSP) - HLA 基因分型 - 微測(cè)序 - 實(shí)時(shí) PCR(無(wú)需水解探針;使用 SNP PolTaq) - 實(shí)時(shí)多重 PCR

Einheiten / Units:
Quelle / Source:

rec. from E.coli


Sicherheits Hinweise / Safety


Klassifizierungen / Classification

eclass-Nr: 32-16-05-02


Genaxxon可持續(xù)生產(chǎn)和交易。我們的產(chǎn)品盡可能在德國(guó)制造。運(yùn)輸時(shí)要注意二氧化碳中和。 Genaxxon 專注于PCR和實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR),能夠?qū)?的新產(chǎn)品和開發(fā)推向市場(chǎng)。在2017年,我們引入了凍干的qPCR 預(yù)混液,其形式為珠粒(LyoBalls>),預(yù)先分裝在試管條或PCR板中或呈粉末狀(LyoMix>)。這些預(yù)混合料具有液體預(yù)混合料的所有優(yōu)點(diǎn),但相比之下,在室溫下穩(wěn)定,無(wú)需冷卻。 這些凍干的預(yù)混合物是我們實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)預(yù)混合物的進(jìn)一步開發(fā)。其中包括帶有和不帶有熒光染料的Green和Probe qPCR主混合物。這些產(chǎn)品針對(duì)羅氏(LightCycler?480),Qiagen(Rotor-Gene?),LifeTechnologies(StepOnePlus?)和Applied Biosystems(Mx3005P?)等市場(chǎng)PCR裝置進(jìn)行了專門調(diào)整和優(yōu)化。


上海牧榮生物科技有限公司 是一家專注于分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、細(xì)菌學(xué)、遺傳學(xué)、免疫學(xué)、生物化學(xué)、蛋白質(zhì)學(xué)、細(xì)胞治療、臨床應(yīng)用等領(lǐng)域,以銷售為主的生物技術(shù)公司。銷售的產(chǎn)品涉及,細(xì)胞株和菌株、胎牛血清、生化試劑、ELISA試劑盒、抗體和抗原、細(xì)胞因子、技術(shù)服務(wù)、實(shí)驗(yàn)耗材和消耗品、儀器設(shè)備等??蛻舯椴即髮W(xué)、研究所、醫(yī)院、衛(wèi)生防疫、商品檢驗(yàn)檢疫、制藥公司、生物技術(shù)公司和食品工業(yè)等單位。Genaxxon銷售

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